
姓名:林建平
职称:教授
邮箱:jianpinglin@nankai.edu.cn
办公地址:天津市海河教育园区同砚路38号南开大学药学院
研究方向:计算机辅助药物设计,生物大分子模拟,蛋白质电子转移
教育背景与工作经历:
1997年和2000年先后在北京大学化学院获得学士和硕士学位。
2005年毕业于美国杜克大学,获得理论生物物理和化学博士学位。
2006年在美国希望之城医学中心从事博士后工作。
2009年作为引进人才,回国到南开大学工作。
研究成果:
林建平实验室主要研究工作集中在计算生物学方向。主要有以下两方向:(1)对复杂生物体系如DNA六元纳米管、GPCR、核蛋白等进行模拟,解释其生物现象。(2)计算机辅助药物设计包括发展药物设计方法如粗粒化对接、靶标预测方法。并针对多个体系进行多级虚拟筛选并找到超过10个苗头化合物。蛋白体系包括:HIV-1蛋白酶、HCVNS5B聚合酶、PAD4等。发表论文30篇,主要发表在Science、PCCP、Scientific Reports、 Journal of Cheminformatics、Plos one、European JMC等。
代表性论文:
1. Hengkai Meng, Pi Liu, Hongbing Sun, Zhen Cai, Jie Zhou*, Jianping Lin*, Yin Li*, Engineering a D-lactate dehydrogenase that can superefficiently utilize NADPH and NADH as cofactors, Sci. Rep. 2016, 6: 24887.
2. Zhonghua Wang, Lu Liang, Zheng Yin, Jianping Lin*, Improving chemical similarity ensemble approach in target prediction, J. Cheminf. 2016, 8: 20.
3. Yang Li, Jixue Sun, Dongmei Li*, Jianping Lin*, Activation and conformational dynamics of a classB G-protein-coupled glucagon receptor, Phys. Chem. Chem. Phys. 2016, 18: 12642-12650.
4. Wei, Yu, Jinlong Li, Jie Qing, Mingjie Huang, Ming Wu, Fenghua Gao, Dongmei Li, Zhangyong Hong, Lingbao Kong*, Weiqiang Huang*, Jianping Lin*, Discovery of novel hepatitis C virus NS5B polymerase inhibitors by combining random forest, multiple e-pharmacophore modeling and docking, PLoS ONE 2016, 11: e0148181.
5. Qiaoyun Guo, Yu Wei, Bin Xia, Yongxin Jin, Chang Liu, Xiaolei Pan, Jing Shi, Feng Zhu, Jinlong Li, Lei Qian, Xinqi Liu, Zhihui Cheng, Shouguang Jin*, Jianping Lin*, Weihui Wu*, Identification of a small molecule that simultaneously suppresses virulence and antibiotic resistance of Pseudomonas aeruginosa, Sci. Rep. 2015, 6: 19141.
