本实验室是国家重点实验室，主要在药物靶标的疾病分子机制、药物设计的结构基础、药物分子合成与筛选、药物分子生物分析及药物分子的传输等五个方向开展基础研究。实行“开放、流动、联合、竞争”的运行机制。宗旨是将本室建设成为国家科技创新体系的重要组成部分，是国家组织高水平基础研究和应用基础研究、聚集和培养优秀科学家、开展学术交流和培养高层次创新人才的重要基地，促进学科交叉和学术交流，获取原始创新成果和自主知识产权。把实验室建设成为能代表国家学术水平、实验水平和管理水平的科学研究基地与人才培养及学术活动中心。